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不同间充质干细胞分泌的细胞因子和生长因子也有所不同，临床研究中也会有不同的治疗疾病。总而言之，脐带、胎盘是临床应用的的种子细胞来源，在再生医学研究领域应用广泛，临床前景广阔。脐带及胎盘是婴儿出生时唯一一次获取高质量、高纯度间充质干细胞的机会。脂肪间充质干细胞（Adipose-derived Mesenchymal Stem Cells, ADSCs）是来源于脂肪组织的干细胞，与其它成体干细胞一样具有增殖和多向分化的能力，在导条件下可以分化成为神经细胞、免疫细胞、胰岛细胞、肌细胞、肝细胞、软骨细胞、基质细胞。脂肪间充质干细胞，取材容易，来源，脂肪中干细胞浓度高出骨髓500倍以上，细胞性状较其他干细胞培养更加稳定，，分化能力强大，在特定条件下可定向导分化为各个系统的功能细胞。而且脂肪干细胞不会根据人的年龄增长而活性下降，相对比其他来源的干细胞，脂肪干细胞更加稳定。
脂肪组织是一种可再生的干细胞来源，多数脂肪干细胞来源于脂肪组织中的纤维组织和血管壁，少数游离于脂肪间。脂肪干细胞可分化成骨骼、脂肪、心肌、神经等多种组织，同时释放重要的生长因子、细胞因子来促进伤口愈合、调节炎症反应、减少瘢痕形成和抗衰老。在抗衰老应用中，脂肪干细胞不仅可以作为填充剂，还可成为永久性的再生剂，其分化能力强，因而抗衰老效果明显，疗效持久。
根据美国国立卫生研究院（NIH）临床研究数据信息相关研究资料显示，目前可搜索到超过376项已经完成或正在进行与脐带干细胞相关的临床研究中，国内间充质干细胞临床研究有83项。脂肪间充质干细胞脂肪间充质干细胞（Adipose-derived Mesenchymal Stem Cells, ADSCs）是来源于脂肪组织的干细胞，与其它成体干细胞一样具有增殖和多向分化的能力，在导条件下可以分化成为神经细胞、免疫细胞、胰岛细胞、肌细胞、肝细胞、软骨细胞、基质细胞。
成体干细胞是存在于全身各种组织中的未分化细胞，可以分化成不同的细胞类型。这些细胞在维持它们所在的组织方面发挥着的作用，并有可能用于组织修复和再生医学。干细胞研究发现，成体干细胞存在于发育的组织和器官中，与胚胎干细胞不同，胚胎干细胞来源于囊胚的内细胞团。成体干细胞的分化能力比胚胎干细胞更有限，它们通常被称为“多能”而不是“多能”。有几种不同类型的成体干细胞，包括产生血细胞的造血干细胞和可以分化成骨骼、软骨和脂肪细胞的间充质干细胞。造血干细胞也称为围产期干细胞，也可以来源于脐带血细胞——这种类型的干细胞与患者的HLA相匹配，以避免免疫排斥。成体干细胞，也称为成体干细胞，已成为许多科学研究的主题，并有可能用于治疗多种疾病和病症，包括糖尿病、帕金森病、脊髓损伤和慢性炎症，甚至有助于减缓整体衰老过程。