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干细胞可以从多种来源获得，包括:脐带组织、脐带血、骨髓、脂肪（脂肪）组织、胎盘组织、牙髓和胚胎。干细胞主要有两种类型:来自胚胎的胚胎干细胞和来自发育的组织（如大脑、皮肤、脐带组织和骨髓）的成体干细胞。第三种人类工程干细胞（导多能干细胞）是成体干细胞，它们在实验室中被改造得更像胚胎干细胞。有几种不同类型的干细胞，包括:胚胎干细胞 (ESC)成体干细胞 (ASC)导多能干细胞 (iPSC)胚胎干细胞 (ESC) 是一种源自胚泡内细胞团的干细胞，胚泡是胚胎发育的早期阶段。胚胎干细胞位于内部细胞团中，被科学家称为全能细胞。人类胚胎干细胞可以在体内分化成细胞类型，并可能用于各种医学目的，包括组织修复和再生医学。
值得注意的是，使用成体干细胞仍然是一个活跃的研究领域。需要更多的研究来充分了解这些细胞的潜力，并使用成体干细胞开发有效的疗法。成体干细胞存在于全身的各种组织中，包括脂肪细胞、脐带组织和骨髓。成熟的干细胞可以分化成多种细胞类型，包括:皮肤细胞、肌肉细胞、脑细胞、心肌细胞、神经细胞、心脏细胞和组织。间充质干细胞是具有自我更新、免疫调节、、信号转导、细胞分裂和分化特性的成体干细胞。MSCs 自我更新能力的特点是它们能够在特定组织或器官中分裂和发育成多种特化细胞类型。当置于细胞培养物中并进行体外受精时，MSC可能会成为的干细胞类型并产生更多的干细胞。（体外受精可以帮助在实验室环境中培养干细胞。MSC还可以替代受损或患病的细胞。MSC可以来源于多种组织，包括脂肪组织（脂肪）、骨髓、脐带组织、血液、肝、牙髓和皮肤。
在临床治疗中，造血干细胞应用较早，在20世纪五十年代，临床上就开始应用骨髓移植（BMT）方法来治疗血液系统疾病。到八十年代末，外周血干细胞移植（PBSCT）技术逐渐推广开来，绝大多数为自体外周血干细胞移植（APBSCT），在提高治疗有效率和缩短疗程方面优于常规治疗，且效果令人满意。与两者相比，脐血干细胞移植的长处在于无来源的限制，对HLA配型要求不高，不易受病毒或肿瘤的污染。
一个干细胞可以变体中许多不同的细胞和组织。干细胞成熟为新型细胞的过程称为分化。这个过程是干细胞治疗关键的方面，因为细胞会变体愈合所需的细胞类型。干细胞也可以自我复制；这种能力允许细胞繁殖成相同的自身副本。例如，如果干细胞用于治疗神经损伤，治疗期间施用的细胞可能会变成神经细胞，然后进行复制以自行产生成倍增加的神经细胞。随着时间的推移，这种复制能力大大提高了干细胞治疗的有效性。间充质干细胞是多能干细胞，可以自我更新并分化成不同的细胞类型。换句话说，间充质干细胞可以变成多种不同的细胞类型，包括:脂肪组织、软骨、肌肉、肌腱/韧带、骨骼、神经元和肝细胞 (8)