nk细胞示意图
干细胞疗法可能能够治疗骨科、炎症、自身免疫和神经系统疾病，并针对克罗恩病、多发性硬化症、疮、慢性阻塞性肺病、帕金森氏症、肌萎缩性侧索硬化症、中风康复等进行了研究。干细胞不一定能治愈这些疾病。前提是让身体能够很好地自我修复，以长期减轻症状。在许多情况下，仅此一项就可以显着提高患者的生活质量。脐带组织来源的间充质干细胞在体内没有排斥风险。它们是年轻的、免疫的、未分化的细胞，因为它们还没有被“认领”，所以在体内没有排斥反应。
以前无法治愈的神经退行性疾病现在可能可以通过的干细胞疗法进行治疗。再生医学及其益处可能是延长人类寿命的关键。
在临床治疗中，造血干细胞应用较早，在20世纪五十年代，临床上就开始应用骨髓移植（BMT）方法来治疗血液系统疾病。到八十年代末，外周血干细胞移植（PBSCT）技术逐渐推广开来，绝大多数为自体外周血干细胞移植（APBSCT），在提高治疗有效率和缩短疗程方面优于常规治疗，且效果令人满意。与两者相比，脐血干细胞移植的长处在于无来源的限制，对HLA配型要求不高，不易受病毒或肿瘤的污染。
由于不同种族、不同个体的HLA存在差异，采用一定的方法对捐献者和患者的HLA型别进行配型确定，从而选择与患者HLA相匹配的捐献者进行移植。所以HLA在造血干细胞移植的成败中起着决定性作用，是造血干细胞移植治疗成功的关键。同卵（同基因）双生兄弟姐妹间HLA相合率为100%，非同卵（异基因）双生或亲生兄弟姐妹间HLA相合率为25%。人类非血缘关系的HLA相合率是几百分之一到几万之一，在较为罕见的HLA型别中，相合的几率只有几万分之一甚至几十万分之一。中国独生子女家庭普遍，在血缘关系中找到相合供者的机会很小，造血干细胞移植主要依靠在非血缘关系供者中寻找相合供者。