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根据发生学来源分类胚胎干细胞在各种干细胞的研究与应用中，胚胎干细胞更引人注目。胚胎干细胞是指由胚胎内细胞团或原始生殖细胞经体外抑制培养而筛选出的细胞。此外，胚胎干细胞还可以利用体细胞核转移技术来获得。胚胎干细胞具有发育超強性，在理论上可以导分化为机体中种类的细胞；胚胎干细胞在体外可以大量扩增、筛选、冻存和复苏而不会丧失其原有的特性。成体干细胞成体干细胞是指存在于一种已经分化组织中的未分化细胞，这种细胞能够自身更新并且能够特化形成组成该类型组织的细胞。
当受精卵分裂发育成囊胚时，内层细胞团（Inner Cell Mass）的细胞即为胚胎干细胞。胚胎干细胞具有全能性，可以自我更新并具有分化为体内所有组织的能力。早在1970年Martin Evans已从小鼠中分离出胚胎干细胞并在体外进行培养。而人的胚胎干细胞的体外培养直到最近才获得成功。
造血干细胞是体内各种血细胞的唯一来源，它主要存在于骨髓、外周血、脐带血中。今年年初，协和医大血液学研究所的庞文新又在肌肉组织中发现了具有造血潜能的干细胞。造血干细胞的移植是治疗血液系统疾病、先天性遗传疾病以及多发性和转移性恶性肿瘤疾病的有效方法。在临床治疗中，造血干细胞应用较早，在20世纪五十年代，临床上就开始应用骨髓移植（BMT）方法来治疗血液系统疾病。到八十年代末，外周血干细胞移植（PBSCT）技术逐渐推广开来，大多数为自体外周血干细胞移植（APBSCT），在提高治疗和缩短疗程方面优于常规治疗，且效果令人满意。与两者相比，脐血干细胞移植的长处在于无来源的限制，对HLA配型要求不高，不易受或肿瘤的污染。
神经干细胞移植价值:在2020的第71届美国神经病学学会年会上，干细胞疗法已作为6大专题之一被提上日程。因此近几年来，神经干细胞在治疗脑梗塞、脑外伤、帕金森、脑出血、脑萎缩、阿尔兹海默病、运动性神经元病、脑瘫、肌萎缩性侧索硬化症（ALS）、运动失调、舞动病、急性性多发性神经根炎、小儿麻痹、面瘫、末梢神经障碍等多种疾病上都取得了重大进展。目前我国患帕金森超过300万人，渐冻症已超20万人，更有报道老年痴呆人数已超千万，并且随着老年社会的加剧膨大，存在高发病率和高普遍性，状况令人堪忧。